در یک شب خاص پدری به پسر خود راز در مورد اینکه او دارای توانایی های ویژه ای است را می گوید و از او میخواهد که ...

داستان قسمت دوم فیلم روز استقلال ، 20 سال پس قسمت اول اتفاق می‌ افتد. انسان‌ ها بعد از شکست دادن بیگانگان در قسمت قبل ، از تکنولوژی‌ های آنها استفاده کردند تا به پیشرفت‌ های تکنولوژیکِ دست پیدا کنند و این مساله باعث خشمگینی بیگانگان شده است و آنها برای باز پس گرفتن تکنولوژ یشان خود دوباره به زمین حمله می کنند و…