داستان سریال Wayward Pines در مورد مامور سرویس مخفی اتان برک است که در یک ماموریت برای پیدا کردن دو عامل فدرال گم شده به شهر روستایی Wayward Pines می رود. اما با بررسی به جای پاسخ، تنها به سوالات بیشتری می رسد. چه چیزی در Wayward Pines اشتباه است؟ اتان با واقعیت وحشتناکی مواجه است که او ممکن است هرگز از Wayward Pines زنده خارج نشود...